Zranitelnosti ve zpracování formátu Flash je častým bezpečnostním rizikem. Microsoft proto nyní výslovně doporučuje uživatelům Windows XP, aby si přehrávač aktualizovali.
S operačním systémem Windows XP byla původně dodávána verze 6, v níž bylo od té doby objeveno mnoho bezpečnostních chyb. Řadu z nich lze zneužít ke vzdálenému spuštění kódu po pouhé návštěvě webu obsahujícího útočný soubor ve formátu SWF. Adobe samotná skončila s podporou Flash Playeru 6 již v roce 2006. Aktuální verze má číslo 10.0.42.34.
Ve Windows Vista a Windows 7 je předinstalována již novější verze přehrávače Flash a uživatelé by tedy měli být ve větším bezpečí.
Přehrávač Flash nemá žádný systém automatických aktualizací. I když Adobe nyní takový systém připravuje (Adobe nabídne automatické aktualizace), v první fázi bude určen pouze pro Reader/Acrobat.
Zkontrolovat verzi přehrávače Flah lze na webu Adobe.